Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXC1Q12948 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FOXC1Q12948 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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