Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXF2Q12947 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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