Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF1Q12946 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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