Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN1Q12860 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN1Q12860 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN1Q12860 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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