Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF5AQ12840 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF5AQ12840 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms