Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YER134CYER134C 537 nt5.72□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 VPS29YHR012W 849 nt5.72□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 MTG1YMR097C 1104 nt5.72□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 TOS3YGL179C 1683 nt5.72□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 KAR1YNL188W 1302 nt5.72□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 SAP155YFR040W 3009 nt5.72□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 FUM1YPL262W 1467 nt5.71□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 GLT1YDL171C 6438 nt5.71□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 SMP1YBR182C 1359 nt5.71□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 IXR1YKL032C 1794 nt5.71□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 MET3YJR010W 1536 nt5.71□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 GRX6YDL010W 696 nt5.71□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 YPR1YDR368W 939 nt5.71□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 HSP31YDR533C 714 nt5.71□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 JAC1YGL018C 555 nt5.71□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 SCW10YMR305C 1170 nt5.71□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 HRT1YOL133W 366 nt5.71□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 YBR089WYBR089W 600 nt5.71□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 MSC7YHR039C 1935 nt5.71□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 NUP116YMR047C 3342 nt5.71□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt5.7□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 YDL158CYDL158C 309 nt5.7□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 SEH1YGL100W 1050 nt5.7□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 ECT1YGR007W 972 nt5.7□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 BGL2YGR282C 942 nt5.7□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 FUN19YAL034C 1242 nt5.7□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 ATG33YLR356W 594 nt5.7□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 RTG3YBL103C 1461 nt5.7□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 YHR182WYHR182W 2358 nt5.7□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.69□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 SPO74YGL170C 1242 nt5.69□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 YGR283CYGR283C 1026 nt5.69□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 NSG1YHR133C 876 nt5.69□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 MRPL6YHR147C 645 nt5.69□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 YJL215CYJL215C 360 nt5.69□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 ECM1YAL059W 639 nt5.69□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 CSR1YLR380W 1227 nt5.69□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 YIP3YNL044W 531 nt5.69□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 SLX1YBR228W 915 nt5.69□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 JEM1YJL073W 1938 nt5.69□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 THP1YOL072W 1368 nt5.68□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 YDR222WYDR222W 1248 nt5.68□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 SAY1YGR263C 1275 nt5.68□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 MTW1YAL034W-A 870 nt5.68□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 SFT2YBL102W 648 nt5.68□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 ARG8YOL140W 1272 nt5.68□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 DCP1YOL149W 696 nt5.68□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 UBA3YPR066W 900 nt5.68□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 SUM1YDR310C 3189 nt5.68□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 GAL4YPL248C 2646 nt5.68□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 FZO1YBR179C 2568 nt5.67□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 SIA1YOR137C 1869 nt5.67□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 IBA57YJR122W 1494 nt5.67□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 YCR016WYCR016W 873 nt5.67□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 NIT2YJL126W 924 nt5.67□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.67□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 PAU17YLL025W 375 nt5.67□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 MIM2YLR099W-A 264 nt5.67□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 UIP3YAR027W 708 nt5.67□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 TAZ1YPR140W 1146 nt5.67□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 MCM4YPR019W 2802 nt5.67□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 RPT2YDL007W 1314 nt5.67□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 CMK1YFR014C 1341 nt5.67□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 KRS1YDR037W 1776 nt5.67□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 RAT1YOR048C 3021 nt5.66□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 MRPL32YCR003W 552 nt5.66□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt5.66□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 YEL077CYEL077C 3834 nt5.66□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 YIL028WYIL028W 399 nt5.66□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 ATG19YOL082W 1248 nt5.66□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 ISU2YOR226C 471 nt5.66□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 BTS1YPL069C 1008 nt5.66□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 GRE1YPL223C 507 nt5.66□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 CKS1YBR135W 453 nt5.66□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 ASF2YDL197C 1578 nt5.66□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 MLF3YNL074C 1359 nt5.66□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 SIP5YMR140W 1470 nt5.65□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 DRN1YGR093W 1524 nt5.65□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 INO2YDR123C 915 nt5.65□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 NSE3YDR288W 912 nt5.65□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 ECM15YBL001C 315 nt5.65□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 YOR289WYOR289W 756 nt5.65□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 SUI3YPL237W 858 nt5.65□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 MET16YPR167C 786 nt5.65□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 snR3snR3 194 nt5.65□□□□□ -1.5
CLF1Q12309 OMS1YDR316W 1416 nt5.65□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 SER33YIL074C 1410 nt5.65□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 NOP8YOL144W 1455 nt5.64□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 MGR3YMR115W 1506 nt5.64□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 IFM1YOL023W 2031 nt5.64□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 PCL2YDL127W 927 nt5.64□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 CAB4YGR277C 918 nt5.64□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 ARD1YHR013C 717 nt5.64□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 SPL2YHR136C 447 nt5.64□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 KTI12YKL110C 942 nt5.64□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 PEX27YOR193W 1131 nt5.64□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 VPS36YLR417W 1701 nt5.64□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 GPR1YDL035C 2886 nt5.64□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 FUI1YBL042C 1920 nt5.64□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 ADE4YMR300C 1533 nt5.64□□□□□ -1.51
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