Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY3A-G	Q12173	FZO1	YBR179C	2568 nt		5.04	□□□□□ -1.6
TY3A-G	Q12173	DAL81	YIR023W	2913 nt		5.03	□□□□□ -1.6
TY3A-G	Q12173	CUE2	YKL090W	1332 nt		5.03	□□□□□ -1.6
TY3A-G	Q12173	SED4	YCR067C	3198 nt		5.03	□□□□□ -1.6
TY3A-G	Q12173	RCR2	YDR003W	633 nt		5.03	□□□□□ -1.6
TY3A-G	Q12173	DPB4	YDR121W	591 nt		5.03	□□□□□ -1.6
TY3A-G	Q12173	YHR145C	YHR145C	357 nt		5.03	□□□□□ -1.6
TY3A-G	Q12173	SPS18	YNL204C	903 nt		5.03	□□□□□ -1.6
TY3A-G	Q12173	SCP1	YOR367W	603 nt		5.03	□□□□□ -1.6
TY3A-G	Q12173	YOR379C	YOR379C	339 nt		5.03	□□□□□ -1.6
TY3A-G	Q12173	HAL1	YPR005C	885 nt		5.03	□□□□□ -1.6
TY3A-G	Q12173	COP1	YDL145C	3606 nt		5.03	□□□□□ -1.6
TY3A-G	Q12173	RFT1	YBL020W	1725 nt		5.03	□□□□□ -1.6
TY3A-G	Q12173	TUB3	YML124C	1338 nt		5.02	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	BUD16	YEL029C	939 nt		5.02	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	RPL14A	YKL006W	417 nt		5.02	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	TLG2	YOL018C	1194 nt		5.02	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	MET31	YPL038W	534 nt		5.02	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	PCL8	YPL219W	1479 nt		5.01	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	UPS3	YDR185C	540 nt		5.01	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	CBT1	YKL208W	816 nt		5.01	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	PPG1	YNR032W	1107 nt		5.01	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	GAL4	YPL248C	2646 nt		5.01	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	SUP35	YDR172W	2058 nt		5	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	UBP7	YIL156W	3216 nt		5	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	FRA2	YGL220W	363 nt		5	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	CAX4	YGR036C	720 nt		5	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	YIL165C	YIL165C	360 nt		5	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	ISY1	YJR050W	708 nt		5	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	YML057C-A	YML057C-A	390 nt		5	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	SMA1	YPL027W	738 nt		5	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	PAL1	YDR348C	1500 nt		5	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	UBP9	YER098W	2265 nt		5	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	PMT2	YAL023C	2280 nt		5	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	YMR196W	YMR196W	3267 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	GAD1	YMR250W	1758 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	PDR12	YPL058C	4536 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	YER145C-A	YER145C-A	438 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	SUP56	tL(CAA)A	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	SUP53	tL(CAA)C	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	tL(CAA)D	tL(CAA)D	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	tL(CAA)G1	tL(CAA)G1	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	SUP54	tL(CAA)G2	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	tL(CAA)G3	tL(CAA)G3	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	tL(CAA)K	tL(CAA)K	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	tL(CAA)L	tL(CAA)L	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	tL(CAA)M	tL(CAA)M	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	tL(CAA)N	tL(CAA)N	82 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	MTM1	YGR257C	1101 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	tS(AGA)D3	tS(AGA)D3	83 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	KEX1	YGL203C	2190 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	PHO90	YJL198W	2646 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	LCB2	YDR062W	1686 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	GCN20	YFR009W	2259 nt		4.98	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	MSC7	YHR039C	1935 nt		4.98	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	ROT2	YBR229C	2865 nt		4.98	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	CNB1	YKL190W	528 nt		4.98	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	GMH1	YKR030W	822 nt		4.98	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	YLR154W-B	YLR154W-B	165 nt		4.98	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	ATG17	YLR423C	1254 nt		4.98	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	IMD3	YLR432W	1572 nt		4.98	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	STE7	YDL159W	1548 nt		4.97	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	MGS1	YNL218W	1764 nt		4.97	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	TMA17	YDL110C	453 nt		4.97	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	AAD4	YDL243C	990 nt		4.97	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	CDC4	YFL009W	2340 nt		4.97	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	KAR2	YJL034W	2049 nt		4.97	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	FRE7	YOL152W	1863 nt		4.96	□□□□□ -1.61
TY3A-G	Q12173	MPH2	YDL247W	1830 nt		4.96	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	RPC53	YDL150W	1269 nt		4.96	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	YDR417C	YDR417C	372 nt		4.96	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	SFK1	YKL051W	1062 nt		4.96	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	PDR15	YDR406W	4590 nt		4.96	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	LEU1	YGL009C	2340 nt		4.96	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	YGR153W	YGR153W	654 nt		4.95	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	PCT1	YGR202C	1275 nt		4.95	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	MTF1	YMR228W	1026 nt		4.95	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	SUL2	YLR092W	2682 nt		4.94	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	REC114	YMR133W	1287 nt		4.94	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	TRS33	YOR115C	807 nt		4.94	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	UBX7	YBR273C	1311 nt		4.94	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	YCR023C	YCR023C	1836 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	CBP1	YJL209W	1965 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	MET12	YPL023C	1974 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	HPM1	YIL110W	1134 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	UTP11	YKL099C	753 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	YNL228W	YNL228W	777 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	PDX3	YBR035C	687 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	RET3	YPL010W	570 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	RMI1	YPL024W	726 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	YPR109W	YPR109W	885 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	FRE1	YLR214W	2061 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	BSC5	YNR069C	1470 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	TOS3	YGL179C	1683 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	ALG2	YGL065C	1512 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	MET3	YJR010W	1536 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	KGD1	YIL125W	3045 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	TFG1	YGR186W	2208 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	GLC3	YEL011W	2115 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TY3A-G	Q12173	CDC12	YHR107C	1224 nt		4.92	□□□□□ -1.62

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