Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCRN3Q0VDG4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCRN3Q0VDG4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCRN3Q0VDG4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCRN3Q0VDG4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCRN3Q0VDG4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCRN3Q0VDG4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SCRN3Q0VDG4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SCRN3Q0VDG4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCRN3Q0VDG4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCRN3Q0VDG4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCRN3Q0VDG4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCRN3Q0VDG4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCRN3Q0VDG4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCRN3Q0VDG4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCRN3Q0VDG4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCRN3Q0VDG4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms