Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAGPQ0VAQ4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms