Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
RBL2Q08999 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBL2Q08999 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RBL2Q08999 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RBL2Q08999 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RBL2Q08999 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBL2Q08999 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBL2Q08999 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBL2Q08999 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RBL2Q08999 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBL2Q08999 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBL2Q08999 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RBL2Q08999 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBL2Q08999 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms