Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD47Q08722 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD47Q08722 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD47Q08722 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD47Q08722 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CD47Q08722 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CD47Q08722 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD47Q08722 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD47Q08722 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CD47Q08722 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CD47Q08722 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD47Q08722 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CD47Q08722 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD47Q08722 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD47Q08722 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD47Q08722 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD47Q08722 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD47Q08722 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD47Q08722 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD47Q08722 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD47Q08722 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD47Q08722 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD47Q08722 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD47Q08722 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD47Q08722 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD47Q08722 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD47Q08722 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD47Q08722 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD47Q08722 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD47Q08722 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD47Q08722 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD47Q08722 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD47Q08722 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD47Q08722 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD47Q08722 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD47Q08722 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD47Q08722 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD47Q08722 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD47Q08722 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD47Q08722 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD47Q08722 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD47Q08722 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD47Q08722 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD47Q08722 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD47Q08722 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD47Q08722 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CD47Q08722 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD47Q08722 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD47Q08722 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD47Q08722 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD47Q08722 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD47Q08722 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD47Q08722 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD47Q08722 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD47Q08722 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CD47Q08722 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD47Q08722 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD47Q08722 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD47Q08722 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD47Q08722 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD47Q08722 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD47Q08722 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD47Q08722 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD47Q08722 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD47Q08722 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CD47Q08722 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD47Q08722 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD47Q08722 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD47Q08722 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD47Q08722 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD47Q08722 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD47Q08722 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD47Q08722 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD47Q08722 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD47Q08722 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD47Q08722 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CD47Q08722 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD47Q08722 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CD47Q08722 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD47Q08722 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD47Q08722 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD47Q08722 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD47Q08722 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CD47Q08722 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD47Q08722 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD47Q08722 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD47Q08722 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD47Q08722 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD47Q08722 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD47Q08722 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD47Q08722 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD47Q08722 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD47Q08722 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD47Q08722 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CD47Q08722 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD47Q08722 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CD47Q08722 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD47Q08722 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD47Q08722 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CD47Q08722 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms