Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE4DQ08499 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms