Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LTBQ06643 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LTBQ06643 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBQ06643 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBQ06643 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBQ06643 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBQ06643 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBQ06643 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBQ06643 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBQ06643 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBQ06643 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBQ06643 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBQ06643 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBQ06643 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTBQ06643 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBQ06643 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBQ06643 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBQ06643 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBQ06643 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBQ06643 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBQ06643 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBQ06643 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBQ06643 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTBQ06643 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBQ06643 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBQ06643 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBQ06643 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBQ06643 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBQ06643 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBQ06643 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTBQ06643 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBQ06643 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBQ06643 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBQ06643 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBQ06643 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBQ06643 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBQ06643 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBQ06643 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBQ06643 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBQ06643 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBQ06643 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTBQ06643 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
LTBQ06643 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LTBQ06643 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LTBQ06643 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBQ06643 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBQ06643 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBQ06643 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBQ06643 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBQ06643 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBQ06643 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBQ06643 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBQ06643 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBQ06643 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBQ06643 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBQ06643 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBQ06643 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBQ06643 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBQ06643 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBQ06643 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBQ06643 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBQ06643 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBQ06643 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBQ06643 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBQ06643 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBQ06643 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBQ06643 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBQ06643 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBQ06643 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBQ06643 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBQ06643 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBQ06643 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBQ06643 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBQ06643 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBQ06643 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBQ06643 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBQ06643 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBQ06643 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBQ06643 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBQ06643 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBQ06643 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBQ06643 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBQ06643 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBQ06643 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBQ06643 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBQ06643 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBQ06643 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBQ06643 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBQ06643 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBQ06643 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBQ06643 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBQ06643 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBQ06643 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBQ06643 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBQ06643 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBQ06643 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBQ06643 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBQ06643 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBQ06643 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBQ06643 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms