Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GABPAQ06546 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms