Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPN11Q06124 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN11Q06124 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms