Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNP2Q05952 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNP2Q05952 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNP2Q05952 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNP2Q05952 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNP2Q05952 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNP2Q05952 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNP2Q05952 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNP2Q05952 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNP2Q05952 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNP2Q05952 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNP2Q05952 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNP2Q05952 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNP2Q05952 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNP2Q05952 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNP2Q05952 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNP2Q05952 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNP2Q05952 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNP2Q05952 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNP2Q05952 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNP2Q05952 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNP2Q05952 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TNP2Q05952 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNP2Q05952 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNP2Q05952 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNP2Q05952 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNP2Q05952 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNP2Q05952 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNP2Q05952 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNP2Q05952 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNP2Q05952 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNP2Q05952 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNP2Q05952 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNP2Q05952 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNP2Q05952 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TNP2Q05952 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNP2Q05952 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNP2Q05952 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNP2Q05952 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNP2Q05952 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNP2Q05952 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNP2Q05952 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNP2Q05952 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNP2Q05952 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNP2Q05952 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNP2Q05952 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNP2Q05952 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNP2Q05952 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNP2Q05952 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNP2Q05952 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNP2Q05952 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNP2Q05952 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNP2Q05952 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms