Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms