Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1Q04771 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1Q04771 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms