Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EMX2Q04743 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMX2Q04743 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms