Protein–RNA interactions for Protein: Q04264

PDS5, Sister chromatid cohesion protein PDS5, yeastyeast

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDS5Q04264 RER1YCL001W 567 nt5.71□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 PHM7YOL084W 2976 nt5.71□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 FOX2YKR009C 2703 nt5.7□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 LYS5YGL154C 819 nt5.7□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 FMP46YKR049C 402 nt5.7□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 JHD2YJR119C 2187 nt5.7□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 CTT1YGR088W 1689 nt5.69□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 ASN1YPR145W 1719 nt5.69□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 SOH1YGL127C 384 nt5.69□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 RRN9YMR270C 1098 nt5.69□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 TIF5YPR041W 1218 nt5.69□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 FLO8YER109C 2400 nt5.69□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 SEC18YBR080C 2277 nt5.69□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 CLF1YLR117C 2064 nt5.68□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 COQ4YDR204W 1008 nt5.68□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 FRA2YGL220W 363 nt5.68□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 RDL1YOR285W 420 nt5.68□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 DDC1YPL194W 1839 nt5.68□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 FLC3YGL139W 2409 nt5.68□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 VMS1YDR049W 1899 nt5.68□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 ECM7YLR443W 1347 nt5.68□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 PRD1YCL057W 2139 nt5.68□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 RAD52YML032C 1416 nt5.67□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 GDH2YDL215C 3279 nt5.67□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 EGT2YNL327W 3126 nt5.67□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 NUP42YDR192C 1293 nt5.67□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 ADK2YER170W 678 nt5.67□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt5.67□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 PDX3YBR035C 687 nt5.67□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 GCR1YPL075W 2358 nt5.67□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 YNL095CYNL095C 1929 nt5.66□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 HIS4YCL030C 2400 nt5.66□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 YDR056CYDR056C 618 nt5.66□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 BUD13YGL174W 801 nt5.66□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt5.66□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 YAR061WYAR061W 204 nt5.66□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 YLR407WYLR407W 687 nt5.66□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 ELC1YPL046C 300 nt5.66□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 BSC5YNR069C 1470 nt5.65□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 CDC42YLR229C 576 nt5.65□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 SUA7YPR086W 1038 nt5.65□□□□□ -1.5
PDS5Q04264 HOS2YGL194C 1359 nt5.65□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt5.64□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 YNL228WYNL228W 777 nt5.64□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 REG2YBR050C 1017 nt5.64□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 SUL2YLR092W 2682 nt5.64□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 STB3YDR169C 1542 nt5.64□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 THS1YIL078W 2205 nt5.63□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 CNB1YKL190W 528 nt5.63□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 CLB4YLR210W 1383 nt5.63□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 PTR2YKR093W 1806 nt5.62□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 RAD27YKL113C 1149 nt5.62□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 YMR147WYMR147W 672 nt5.62□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 KAP114YGL241W 3015 nt5.61□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 YCR006CYCR006C 474 nt5.61□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 PEX7YDR142C 1128 nt5.61□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 CYM1YDR430C 2970 nt5.61□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 API2YDR525W 330 nt5.61□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 YKR073CYKR073C 321 nt5.61□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 PSY4YBL046W 1326 nt5.6□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 RXT3YDL076C 885 nt5.6□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 TAF10YDR167W 621 nt5.6□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt5.6□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt5.6□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt5.6□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt5.6□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt5.6□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt5.6□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt5.6□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 YML131WYML131W 1098 nt5.6□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 CWC25YNL245C 540 nt5.6□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 ARN1YHL040C 1884 nt5.6□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 GUP2YPL189W 1830 nt5.6□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 UTP9YHR196W 1728 nt5.6□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 VBA1YMR088C 1689 nt5.59□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 ERG7YHR072W 2196 nt5.59□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 KRE28YDR532C 1158 nt5.59□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 BNA6YFR047C 888 nt5.59□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 YML031C-AYML031C-A 336 nt5.59□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 AST1YBL069W 1290 nt5.59□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 ADE6YGR061C 4077 nt5.59□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 YTA6YPL074W 2265 nt5.59□□□□□ -1.51
PDS5Q04264 RAD57YDR004W 1383 nt5.58□□□□□ -1.52
PDS5Q04264 YCR023CYCR023C 1836 nt5.58□□□□□ -1.52
PDS5Q04264 NPY1YGL067W 1155 nt5.58□□□□□ -1.52
PDS5Q04264 YAR030CYAR030C 342 nt5.58□□□□□ -1.52
PDS5Q04264 RSA3YLR221C 663 nt5.58□□□□□ -1.52
PDS5Q04264 YBL010CYBL010C 843 nt5.58□□□□□ -1.52
PDS5Q04264 DOM34YNL001W 1161 nt5.58□□□□□ -1.52
PDS5Q04264 RFA2YNL312W 822 nt5.58□□□□□ -1.52
PDS5Q04264 PEP5YMR231W 3090 nt5.58□□□□□ -1.52
PDS5Q04264 EIS1YMR031C 2532 nt5.57□□□□□ -1.52
PDS5Q04264 TRM11YOL124C 1302 nt5.57□□□□□ -1.52
PDS5Q04264 EFB1YAL003W 621 nt5.57□□□□□ -1.52
PDS5Q04264 YJL215CYJL215C 360 nt5.57□□□□□ -1.52
PDS5Q04264 CSR1YLR380W 1227 nt5.57□□□□□ -1.52
PDS5Q04264 FRT2YAL028W 1587 nt5.57□□□□□ -1.52
PDS5Q04264 HOYDL227C 1761 nt5.57□□□□□ -1.52
PDS5Q04264 CYK3YDL117W 2658 nt5.56□□□□□ -1.52
PDS5Q04264 ISR1YPR106W 1332 nt5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.7 ms