Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF90Q03938 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms