Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP2Q03169 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms