Protein–RNA interactions for Protein: Q02821

SRP1, Importin subunit alpha, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP1Q02821 NSE1YLR007W 1011 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 PER33YLR064W 822 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 SET6YPL165C 1122 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 MUM2YBR057C 1101 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 MRP2YPR166C 348 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 EKI1YDR147W 1605 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 RAD3YER171W 2337 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 HPC2YBR215W 1878 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 PSE1YMR308C 3270 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 CYK3YDL117W 2658 nt5.71□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 ATG1YGL180W 2694 nt5.71□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 LDB17YDL146W 1476 nt5.71□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YLR108CYLR108C 1458 nt5.71□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 IMA5YJL216C 1746 nt5.71□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 OCA4YCR095C 1089 nt5.71□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 SIT4YDL047W 936 nt5.71□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 MSS2YDL107W 1056 nt5.71□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 GRX4YER174C 735 nt5.71□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YGR015CYGR015C 987 nt5.71□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt5.71□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 GTT1YIR038C 705 nt5.71□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 RPC25YKL144C 639 nt5.71□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YLR202CYLR202C 327 nt5.71□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YML6YML025C 861 nt5.71□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 COX5AYNL052W 462 nt5.71□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 MDJ2YNL328C 441 nt5.71□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YNR025CYNR025C 360 nt5.71□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 CAM1YPL048W 1248 nt5.71□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YPR071WYPR071W 636 nt5.71□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 PPM2YOL141W 2088 nt5.71□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 GPA2YER020W 1350 nt5.7□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.7□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YPT1YFL038C 621 nt5.7□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YGL188CYGL188C 174 nt5.7□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt5.7□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 ATG36YJL185C 882 nt5.7□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 VPS71YML041C 843 nt5.7□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 AIM33YML087C 939 nt5.7□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 PML39YML107C 1005 nt5.7□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 END3YNL084C 1050 nt5.7□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YIF1YNL263C 945 nt5.7□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 COQ1YBR003W 1422 nt5.7□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 SIS2YKR072C 1689 nt5.69□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 DBP5YOR046C 1449 nt5.69□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 GLE2YER107C 1098 nt5.69□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 NQM1YGR043C 1002 nt5.69□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 LYS1YIR034C 1122 nt5.69□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 RUF23RUF23 254 nt5.69□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 CSL4YNL232W 879 nt5.69□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 MVD1YNR043W 1191 nt5.69□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 MED7YOL135C 669 nt5.69□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 PNO1YOR145C 825 nt5.69□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 RBD2YPL246C 789 nt5.69□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt5.69□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 HEM1YDR232W 1647 nt5.69□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 STT3YGL022W 2157 nt5.69□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 KRS1YDR037W 1776 nt5.68□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 GPM2YDL021W 936 nt5.68□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 FAL1YDR021W 1200 nt5.68□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 PPM1YDR435C 987 nt5.68□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YGR122WYGR122W 1209 nt5.68□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 MIA40YKL195W 1212 nt5.68□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 IRC25YLR021W 540 nt5.68□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 AAT2YLR027C 1257 nt5.68□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 GPN3YLR243W 819 nt5.68□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 ATP20YPR020W 348 nt5.68□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 SOG2YOR353C 2376 nt5.68□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YCR015CYCR015C 954 nt5.67□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 DON1YDR273W 1098 nt5.67□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 STE2YFL026W 1296 nt5.67□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.67□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 TIP20YGL145W 2106 nt5.67□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 AAD10YJR155W 867 nt5.67□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YLR296WYLR296W 327 nt5.67□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 IBD2YNL164C 1056 nt5.67□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 SLZ1YNL196C 897 nt5.67□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 STE20YHL007C 2820 nt5.67□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 HST1YOL068C 1512 nt5.67□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 PFK2YMR205C 2880 nt5.67□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 IFM1YOL023W 2031 nt5.67□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 SHE9YDR393W 1371 nt5.67□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 PCL8YPL219W 1479 nt5.66□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 HXT4YHR092C 1731 nt5.66□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 SEC9YGR009C 1956 nt5.66□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 MDH3YDL078C 1032 nt5.66□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YDR042CYDR042C 603 nt5.66□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 DCV1YFR012W 609 nt5.66□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 BUD32YGR262C 786 nt5.66□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YIL028WYIL028W 399 nt5.66□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 RFA3YJL173C 369 nt5.66□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YKR070WYKR070W 1059 nt5.66□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 GSP1YLR293C 660 nt5.66□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 VMA6YLR447C 1038 nt5.66□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YNL019CYNL019C 855 nt5.66□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YNL033WYNL033W 855 nt5.66□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 EAF7YNL136W 1278 nt5.66□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 CAF40YNL288W 1122 nt5.66□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 BSD2YBR290W 966 nt5.66□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 IME4YGL192W 1803 nt5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.4 ms