Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB1Q02641 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB1Q02641 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms