Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFAP4Q01664 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms