Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAP1Q01518 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAP1Q01518 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAP1Q01518 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms