Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2F1Q01094 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2F1Q01094 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms