Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK3Q00526 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK3Q00526 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK3Q00526 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms