Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXC5Q00444 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC5Q00444 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms