Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HDLBPQ00341 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HDLBPQ00341 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDLBPQ00341 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms