Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFI35P80217 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFI35P80217 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFI35P80217 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFI35P80217 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFI35P80217 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFI35P80217 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFI35P80217 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFI35P80217 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFI35P80217 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFI35P80217 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFI35P80217 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFI35P80217 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
IFI35P80217 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFI35P80217 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFI35P80217 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFI35P80217 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFI35P80217 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IFI35P80217 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFI35P80217 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFI35P80217 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFI35P80217 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFI35P80217 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFI35P80217 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFI35P80217 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IFI35P80217 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFI35P80217 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFI35P80217 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFI35P80217 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IFI35P80217 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFI35P80217 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFI35P80217 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFI35P80217 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFI35P80217 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFI35P80217 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IFI35P80217 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFI35P80217 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFI35P80217 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFI35P80217 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFI35P80217 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFI35P80217 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFI35P80217 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFI35P80217 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFI35P80217 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFI35P80217 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFI35P80217 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFI35P80217 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFI35P80217 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFI35P80217 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFI35P80217 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFI35P80217 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFI35P80217 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFI35P80217 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFI35P80217 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFI35P80217 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFI35P80217 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFI35P80217 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFI35P80217 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFI35P80217 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFI35P80217 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFI35P80217 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFI35P80217 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFI35P80217 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFI35P80217 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFI35P80217 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFI35P80217 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFI35P80217 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IFI35P80217 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFI35P80217 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFI35P80217 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFI35P80217 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFI35P80217 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFI35P80217 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFI35P80217 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFI35P80217 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFI35P80217 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFI35P80217 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFI35P80217 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFI35P80217 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFI35P80217 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFI35P80217 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFI35P80217 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IFI35P80217 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFI35P80217 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFI35P80217 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFI35P80217 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFI35P80217 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IFI35P80217 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFI35P80217 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFI35P80217 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFI35P80217 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFI35P80217 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFI35P80217 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFI35P80217 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFI35P80217 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFI35P80217 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFI35P80217 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFI35P80217 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFI35P80217 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFI35P80217 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms