Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX3P78415 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX3P78415 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX3P78415 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX3P78415 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX3P78415 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX3P78415 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX3P78415 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX3P78415 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX3P78415 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX3P78415 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX3P78415 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX3P78415 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX3P78415 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX3P78415 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX3P78415 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX3P78415 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX3P78415 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX3P78415 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX3P78415 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX3P78415 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX3P78415 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IRX3P78415 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IRX3P78415 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IRX3P78415 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRX3P78415 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRX3P78415 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRX3P78415 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRX3P78415 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRX3P78415 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRX3P78415 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRX3P78415 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRX3P78415 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IRX3P78415 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRX3P78415 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRX3P78415 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRX3P78415 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRX3P78415 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRX3P78415 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
IRX3P78415 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRX3P78415 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRX3P78415 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRX3P78415 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRX3P78415 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRX3P78415 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRX3P78415 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRX3P78415 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRX3P78415 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRX3P78415 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRX3P78415 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRX3P78415 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRX3P78415 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRX3P78415 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRX3P78415 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRX3P78415 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRX3P78415 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRX3P78415 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRX3P78415 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRX3P78415 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRX3P78415 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRX3P78415 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRX3P78415 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRX3P78415 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRX3P78415 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRX3P78415 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRX3P78415 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRX3P78415 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRX3P78415 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRX3P78415 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRX3P78415 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRX3P78415 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRX3P78415 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRX3P78415 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRX3P78415 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
IRX3P78415 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
IRX3P78415 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRX3P78415 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRX3P78415 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRX3P78415 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRX3P78415 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRX3P78415 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRX3P78415 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRX3P78415 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRX3P78415 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRX3P78415 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX3P78415 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX3P78415 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX3P78415 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX3P78415 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX3P78415 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX3P78415 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX3P78415 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX3P78415 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX3P78415 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX3P78415 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX3P78415 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX3P78415 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX3P78415 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX3P78415 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX3P78415 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms