Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM193AP78312 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM193AP78312 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM193AP78312 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM193AP78312 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM193AP78312 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM193AP78312 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM193AP78312 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms