Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNG7P62955 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNG7P62955 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNG7P62955 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNG7P62955 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNG7P62955 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNG7P62955 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNG7P62955 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNG7P62955 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNG7P62955 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNG7P62955 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNG7P62955 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNG7P62955 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNG7P62955 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG7P62955 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNG7P62955 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms