Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL30P62888 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL30P62888 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL30P62888 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL30P62888 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL30P62888 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL30P62888 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL30P62888 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL30P62888 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL30P62888 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL30P62888 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL30P62888 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL30P62888 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL30P62888 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL30P62888 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL30P62888 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL30P62888 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL30P62888 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL30P62888 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL30P62888 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL30P62888 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL30P62888 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL30P62888 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL30P62888 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL30P62888 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL30P62888 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL30P62888 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL30P62888 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL30P62888 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL30P62888 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL30P62888 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL30P62888 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL30P62888 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL30P62888 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL30P62888 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL30P62888 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL30P62888 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL30P62888 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL30P62888 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL30P62888 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL30P62888 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL30P62888 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL30P62888 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL30P62888 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL30P62888 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL30P62888 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL30P62888 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL30P62888 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL30P62888 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL30P62888 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL30P62888 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL30P62888 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL30P62888 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL30P62888 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL30P62888 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL30P62888 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL30P62888 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL30P62888 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL30P62888 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL30P62888 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL30P62888 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL30P62888 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL30P62888 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL30P62888 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL30P62888 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL30P62888 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL30P62888 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL30P62888 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL30P62888 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL30P62888 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL30P62888 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL30P62888 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL30P62888 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL30P62888 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL30P62888 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL30P62888 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL30P62888 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL30P62888 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL30P62888 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL30P62888 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL30P62888 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL30P62888 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL30P62888 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL30P62888 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL30P62888 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL30P62888 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL30P62888 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL30P62888 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL30P62888 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL30P62888 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL30P62888 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL30P62888 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL30P62888 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL30P62888 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL30P62888 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL30P62888 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL30P62888 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL30P62888 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL30P62888 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL30P62888 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms