Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAP1AP62834 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAP1AP62834 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms