Protein–RNA interactions for Protein: P62753

RPS6, 40S ribosomal protein S6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6P62753 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6P62753 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6P62753 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6P62753 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6P62753 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6P62753 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6P62753 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6P62753 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6P62753 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6P62753 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6P62753 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6P62753 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6P62753 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS6P62753 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6P62753 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6P62753 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6P62753 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6P62753 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6P62753 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6P62753 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6P62753 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6P62753 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6P62753 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6P62753 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6P62753 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6P62753 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6P62753 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6P62753 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6P62753 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6P62753 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6P62753 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6P62753 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6P62753 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6P62753 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6P62753 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6P62753 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6P62753 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6P62753 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6P62753 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6P62753 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6P62753 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6P62753 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6P62753 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6P62753 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6P62753 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6P62753 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6P62753 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6P62753 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6P62753 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6P62753 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6P62753 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6P62753 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6P62753 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6P62753 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6P62753 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6P62753 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6P62753 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6P62753 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6P62753 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6P62753 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6P62753 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6P62753 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6P62753 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6P62753 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6P62753 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6P62753 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6P62753 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6P62753 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6P62753 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6P62753 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6P62753 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6P62753 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6P62753 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6P62753 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6P62753 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6P62753 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6P62753 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6P62753 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6P62753 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6P62753 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6P62753 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6P62753 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6P62753 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6P62753 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6P62753 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6P62753 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6P62753 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6P62753 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6P62753 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6P62753 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPS6P62753 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPS6P62753 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPS6P62753 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPS6P62753 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPS6P62753 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPS6P62753 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPS6P62753 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPS6P62753 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RPS6P62753 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPS6P62753 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms