Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS4XP62701 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS4XP62701 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS4XP62701 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS4XP62701 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS4XP62701 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS4XP62701 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS4XP62701 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS4XP62701 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS4XP62701 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RPS4XP62701 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS4XP62701 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms