Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCS1P62166 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCS1P62166 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCS1P62166 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCS1P62166 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCS1P62166 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCS1P62166 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCS1P62166 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCS1P62166 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCS1P62166 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCS1P62166 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCS1P62166 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCS1P62166 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCS1P62166 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCS1P62166 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCS1P62166 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCS1P62166 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCS1P62166 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCS1P62166 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NCS1P62166 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCS1P62166 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCS1P62166 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCS1P62166 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCS1P62166 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCS1P62166 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCS1P62166 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCS1P62166 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCS1P62166 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCS1P62166 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCS1P62166 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NCS1P62166 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCS1P62166 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCS1P62166 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NCS1P62166 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCS1P62166 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCS1P62166 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCS1P62166 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCS1P62166 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCS1P62166 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCS1P62166 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCS1P62166 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCS1P62166 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCS1P62166 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCS1P62166 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCS1P62166 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCS1P62166 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCS1P62166 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCS1P62166 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCS1P62166 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCS1P62166 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCS1P62166 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCS1P62166 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NCS1P62166 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCS1P62166 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCS1P62166 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NCS1P62166 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCS1P62166 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCS1P62166 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCS1P62166 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCS1P62166 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCS1P62166 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCS1P62166 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCS1P62166 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCS1P62166 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCS1P62166 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCS1P62166 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCS1P62166 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCS1P62166 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCS1P62166 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCS1P62166 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCS1P62166 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCS1P62166 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCS1P62166 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCS1P62166 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCS1P62166 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCS1P62166 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCS1P62166 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCS1P62166 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCS1P62166 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCS1P62166 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCS1P62166 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCS1P62166 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NCS1P62166 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCS1P62166 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCS1P62166 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCS1P62166 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCS1P62166 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCS1P62166 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCS1P62166 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCS1P62166 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCS1P62166 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCS1P62166 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCS1P62166 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCS1P62166 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCS1P62166 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCS1P62166 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCS1P62166 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCS1P62166 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NCS1P62166 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCS1P62166 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms