Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPS1P60891 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPS1P60891 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPS1P60891 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PRPS1P60891 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPS1P60891 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms