Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ROMO1P60602 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ROMO1P60602 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms