Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00315P59091 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00315P59091 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms