Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2BFSP57053 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2BFSP57053 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms