Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BACE1P56817 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BACE1P56817 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BACE1P56817 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BACE1P56817 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BACE1P56817 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BACE1P56817 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BACE1P56817 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BACE1P56817 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BACE1P56817 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BACE1P56817 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BACE1P56817 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BACE1P56817 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BACE1P56817 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BACE1P56817 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BACE1P56817 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BACE1P56817 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BACE1P56817 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BACE1P56817 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BACE1P56817 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BACE1P56817 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BACE1P56817 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BACE1P56817 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BACE1P56817 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BACE1P56817 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BACE1P56817 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BACE1P56817 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BACE1P56817 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BACE1P56817 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BACE1P56817 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BACE1P56817 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BACE1P56817 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BACE1P56817 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BACE1P56817 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BACE1P56817 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BACE1P56817 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BACE1P56817 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BACE1P56817 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BACE1P56817 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BACE1P56817 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BACE1P56817 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BACE1P56817 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BACE1P56817 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BACE1P56817 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BACE1P56817 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BACE1P56817 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BACE1P56817 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BACE1P56817 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BACE1P56817 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BACE1P56817 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BACE1P56817 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BACE1P56817 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BACE1P56817 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BACE1P56817 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BACE1P56817 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BACE1P56817 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BACE1P56817 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BACE1P56817 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BACE1P56817 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BACE1P56817 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BACE1P56817 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BACE1P56817 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BACE1P56817 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BACE1P56817 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BACE1P56817 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BACE1P56817 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BACE1P56817 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BACE1P56817 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BACE1P56817 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BACE1P56817 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BACE1P56817 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BACE1P56817 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BACE1P56817 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BACE1P56817 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BACE1P56817 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BACE1P56817 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BACE1P56817 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BACE1P56817 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BACE1P56817 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BACE1P56817 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BACE1P56817 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BACE1P56817 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
BACE1P56817 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BACE1P56817 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BACE1P56817 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BACE1P56817 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BACE1P56817 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BACE1P56817 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BACE1P56817 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BACE1P56817 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BACE1P56817 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BACE1P56817 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BACE1P56817 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BACE1P56817 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BACE1P56817 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BACE1P56817 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BACE1P56817 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BACE1P56817 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BACE1P56817 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BACE1P56817 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms