Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH8P55286 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH8P55286 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH8P55286 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH8P55286 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH8P55286 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH8P55286 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH8P55286 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH8P55286 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH8P55286 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH8P55286 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH8P55286 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH8P55286 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH8P55286 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH8P55286 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH8P55286 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH8P55286 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH8P55286 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH8P55286 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH8P55286 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH8P55286 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH8P55286 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH8P55286 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH8P55286 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH8P55286 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH8P55286 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH8P55286 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH8P55286 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH8P55286 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH8P55286 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH8P55286 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH8P55286 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH8P55286 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH8P55286 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH8P55286 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH8P55286 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH8P55286 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH8P55286 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH8P55286 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH8P55286 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH8P55286 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH8P55286 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH8P55286 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH8P55286 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH8P55286 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH8P55286 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH8P55286 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH8P55286 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH8P55286 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH8P55286 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH8P55286 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH8P55286 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH8P55286 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH8P55286 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH8P55286 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH8P55286 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH8P55286 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH8P55286 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH8P55286 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH8P55286 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH8P55286 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH8P55286 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH8P55286 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH8P55286 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH8P55286 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH8P55286 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH8P55286 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH8P55286 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH8P55286 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH8P55286 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH8P55286 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH8P55286 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH8P55286 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH8P55286 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH8P55286 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH8P55286 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH8P55286 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH8P55286 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH8P55286 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH8P55286 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH8P55286 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH8P55286 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH8P55286 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH8P55286 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH8P55286 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH8P55286 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH8P55286 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH8P55286 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH8P55286 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDH8P55286 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH8P55286 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH8P55286 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH8P55286 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH8P55286 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH8P55286 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH8P55286 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH8P55286 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH8P55286 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH8P55286 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH8P55286 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms