Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPAP53621 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPAP53621 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPAP53621 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPAP53621 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPAP53621 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPAP53621 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPAP53621 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPAP53621 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPAP53621 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPAP53621 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPAP53621 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPAP53621 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPAP53621 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPAP53621 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPAP53621 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPAP53621 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPAP53621 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COPAP53621 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPAP53621 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPAP53621 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPAP53621 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPAP53621 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPAP53621 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPAP53621 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
COPAP53621 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
COPAP53621 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPAP53621 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPAP53621 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPAP53621 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPAP53621 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPAP53621 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPAP53621 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPAP53621 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPAP53621 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPAP53621 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPAP53621 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COPAP53621 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPAP53621 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPAP53621 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPAP53621 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPAP53621 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPAP53621 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPAP53621 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COPAP53621 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPAP53621 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPAP53621 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPAP53621 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPAP53621 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPAP53621 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COPAP53621 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPAP53621 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COPAP53621 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COPAP53621 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPAP53621 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPAP53621 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPAP53621 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPAP53621 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPAP53621 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPAP53621 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPAP53621 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPAP53621 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPAP53621 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPAP53621 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPAP53621 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPAP53621 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPAP53621 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPAP53621 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPAP53621 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPAP53621 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPAP53621 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPAP53621 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPAP53621 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPAP53621 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPAP53621 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPAP53621 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPAP53621 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPAP53621 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPAP53621 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPAP53621 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPAP53621 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPAP53621 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPAP53621 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPAP53621 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPAP53621 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPAP53621 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPAP53621 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPAP53621 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPAP53621 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPAP53621 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPAP53621 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPAP53621 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPAP53621 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPAP53621 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPAP53621 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPAP53621 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPAP53621 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPAP53621 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPAP53621 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPAP53621 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms