Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBX2P52951 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBX2P52951 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GBX2P52951 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX2P52951 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX2P52951 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX2P52951 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX2P52951 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX2P52951 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX2P52951 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX2P52951 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX2P52951 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX2P52951 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX2P52951 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBX2P52951 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX2P52951 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX2P52951 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX2P52951 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX2P52951 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX2P52951 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX2P52951 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX2P52951 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX2P52951 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX2P52951 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX2P52951 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX2P52951 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX2P52951 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBX2P52951 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX2P52951 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX2P52951 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX2P52951 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX2P52951 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX2P52951 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX2P52951 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX2P52951 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX2P52951 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX2P52951 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX2P52951 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX2P52951 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX2P52951 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX2P52951 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX2P52951 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX2P52951 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBX2P52951 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX2P52951 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX2P52951 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX2P52951 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX2P52951 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX2P52951 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX2P52951 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX2P52951 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX2P52951 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX2P52951 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBX2P52951 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBX2P52951 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBX2P52951 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX2P52951 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX2P52951 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX2P52951 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX2P52951 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX2P52951 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX2P52951 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX2P52951 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX2P52951 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX2P52951 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX2P52951 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBX2P52951 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX2P52951 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX2P52951 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX2P52951 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX2P52951 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX2P52951 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX2P52951 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX2P52951 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX2P52951 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX2P52951 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX2P52951 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX2P52951 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX2P52951 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX2P52951 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX2P52951 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX2P52951 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX2P52951 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX2P52951 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX2P52951 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX2P52951 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX2P52951 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX2P52951 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX2P52951 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX2P52951 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX2P52951 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX2P52951 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX2P52951 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX2P52951 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX2P52951 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX2P52951 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX2P52951 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX2P52951 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX2P52951 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX2P52951 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms