Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN3P51790 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN3P51790 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN3P51790 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms