Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
BRCA2P51587 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRCA2P51587 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms