Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms